Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab3bQ9CZT8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms