Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms