Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem175Q9CXY1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem175Q9CXY1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem175Q9CXY1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem175Q9CXY1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem175Q9CXY1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem175Q9CXY1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem175Q9CXY1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem175Q9CXY1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem175Q9CXY1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms