Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpl11Q9CXW4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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