Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mgme1Q9CXC3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mgme1Q9CXC3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mgme1Q9CXC3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mgme1Q9CXC3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mgme1Q9CXC3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mgme1Q9CXC3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mgme1Q9CXC3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mgme1Q9CXC3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mgme1Q9CXC3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms