Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms