Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms