Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smurf1Q9CUN6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms