Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sft2d3Q9CSV6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sft2d3Q9CSV6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sft2d3Q9CSV6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sft2d3Q9CSV6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d3Q9CSV6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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