Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms