Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CR55 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CR55 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CR55 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CR55 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CR55 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CR55 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CR55 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CR55 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CR55 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CR55 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms