Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms