Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR2

Rps21, 40S ribosomal protein S21, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps21Q9CQR2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps21Q9CQR2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps21Q9CQR2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms