Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms