Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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