Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms