Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW3

Mrpl54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl54Q9CPW3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl54Q9CPW3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl54Q9CPW3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms