Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms