Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim12aQ99PQ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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Trim12aQ99PQ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Trim12aQ99PQ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Trim12aQ99PQ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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