Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms