Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms