Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnaja3Q99M87 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnaja3Q99M87 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms