Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnps1Q99M28 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms