Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms