Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf34Q99KR6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf34Q99KR6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms