Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms