Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pls3Q99K51 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pls3Q99K51 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms