Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms