Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms