Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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Nek8Q91ZR4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek8Q91ZR4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Nek8Q91ZR4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Nek8Q91ZR4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Nek8Q91ZR4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Nek8Q91ZR4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Nek8Q91ZR4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Nek8Q91ZR4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Nek8Q91ZR4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Nek8Q91ZR4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Nek8Q91ZR4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Nek8Q91ZR4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek8Q91ZR4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms