Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn3Q91V61 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms