Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacng5Q8VHW4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacng5Q8VHW4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms