Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mark1Q8VHJ5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mark1Q8VHJ5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mark1Q8VHJ5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mark1Q8VHJ5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.3 ms