Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms