Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms