Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Treml1Q8K558 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml1Q8K558 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms