Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc5Q8K4Z2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms