Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms