Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm48Q8K2X2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rbm48Q8K2X2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rbm48Q8K2X2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rbm48Q8K2X2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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