Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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FgbQ8K0E8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FgbQ8K0E8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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FgbQ8K0E8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FgbQ8K0E8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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