Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms