Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip10Q8CJ53 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms