Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms