Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lin52Q8CD94 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin52Q8CD94 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms