Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930507D05RikQ8C9C9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930507D05RikQ8C9C9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms