Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C708 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C708 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C708 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8C708 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8C708 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8C708 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8C708 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8C708 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8C708 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8C708 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8C708 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms