Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc22Q8C5N3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc22Q8C5N3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms