Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rft1Q8C3B8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms