Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdh12Q8BYK4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh12Q8BYK4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms