Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms